最普遍的关于显微镜的发明故事，是在1673年有个名叫列文虎克的荷兰人用自己制造的显微镜观察到了被他称为小动物的微生物世界，他在给英国皇家学会写信，介绍他的观察结果，表明他在雨滴中看到并记录了一类从前没有人看到过的微小生命，因为这个伟大的发现，他当上了英国皇家学会的会员。所以今天我们把列文虎克看成是微生物学的开山祖。列文虎克出生在荷兰东部一个名叫德尔福特的小城市，16岁便在一家眼镜店里当学徒，学会了磨制镜片，在他得到一个很清闲的工作，就用很多时间用来磨放大镜，而且放大倍数越来越高，因为放大倍数越高，透镜就越小，为了用起来方便，把透镜镶嵌在支架的木板上，不久他又给这个装置加了一块透镜，这样的组合透镜放大的倍数更大了。他把自己发明的这个装置称为“显微镜”，再加观察孔和调节距离 ，观察效果极佳，这时一项伟大的发明终于诞生了！，连续好多年，列文虎克先后制作了400多架显微镜，最高的放大倍数达到200—300倍，从列文虎克写给英国皇家学会的200多封附有图画的信里，人们可以断定他是全世界第一个观察到球形、杆状和螺旋形的细菌和原生动物，还第一次描绘了细菌的运动。
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